Mahasiswa diharapkan dapat menyelesaikan program Magister Ilmu Lingkungan dalam 3 sampai 4 semester, dengan jumlah SKS. Jumlah SKS mata kuliah wajib sebanyak 25 SKS, mata kuliah pilihan 6 SKS, dan 10 SKS untuk Kuliah Lapangan, Seminar, dan Tesis. Total SKS semuanya 41 SKS.
Daftar Mata Kuliah Wajib
| No | Mata Kuliah Wajib | SKS |
| SEMESTER I | ||
| 1 | Filsafat Ilmu Lingkungan | 2 |
| 2 | Hukum Lingkungan dan Kebijakan Pengelolaan Sumber Daya Alam | 2 |
| 3 | Perubahan iklim dan mitigasi bencana | 3 |
| 4 | Ekonomi Sumberdaya Alam dan Lingkungan | 3 |
| 5 | Statistika Terapan | 2 |
| SEMESTER II | ||
| 1 | Ekologi dan Konservasi Lahan Basah | 3 |
| 2 | Metode Penelitian Ilmu Lingkungan | 3 |
| 3 | Lingkungan Sosial dan Budaya Masyarakat Kalimantan | 2 |
| 4 | Analisis Sistem Dinamik Lingkungan | 2 |
| 5 | AMDAL dan Audit Lingkungan Hidup | 3 |
| SEMESTER III DAN IV | ||
| 1 | Kuliah Kerja Inter-disiplin Ilmu | 2 |
| 2 | Seminar Pra Penelitian | 1 |
| 3 | Seminar Hasil Penelitian | 1 |
| 4 | Tesis | 6 |
Daftar Mata Kuliah Pilihan(*
| No | Mata Kuliah Pilihan | SKS |
| 1 | Politik Lingkungan Hidup | 2 |
| 2 | Kearifan Lokal dalam Pengelolaan SDA | 2 |
| 3 | Pengembangan Perkotaan dan Wilayah Ramah Lingkungan | 2 |
| 4 | Baku Mutu lingkungan | 2 |
| 5 | Pembangunan Perkebunan dan Kehutanan Berkelanjutan | 2 |
(* tergantung dosen dan minimal dipilih oleh 5 mahasiswa
Magister Ilmu Lingkungan Universitas Tanjungpura 